近年来，巩建华教授对海洋政治进行了深入研究，在该领域产生了积极的影响。记者从巩建华教授那里了解到，2010年以来，他相继在《太平洋学报》、《理论与改革》、《未来与发展》、《当代社科视野》、《新东方》、《中国日报》（英文版）等刊物上发表海洋政治和南海问题方面的论文近20篇。2010年7月13日与2011年6月8日巩建华应邀为《中国日报》相继撰写了《Sea dispute a real test for China》、《Modernizing navy for self-defense》，并接受了国外媒体的电话采访。湛江学者在这一领域的研究引起了相关媒体、学界和社会的关注。巩建华教授表示，尽管这些文章遭到国外学者的“指责”和恶意攻击，但这些“指责”颠倒黑白、毫无道理、不值一提！
巩教授呼吁国人要强化海权观念、提高海洋意识。深刻理解胡锦涛总书记关于“和谐世界”、“和谐的论述，同时也要深刻理解“要始终坚持把国家主权和安全放在第一位，始终坚持军事斗争准备的龙头地位不动摇，毫不放松地推进军事斗争准备。”的精辟论述。并把二者统一起来，谨防断章取义，对国家的海洋战略产生误解。盲目冒进，喊打喊杀，失去理性。他认为湛江是海洋军事重镇，是保卫南海的战略腹地，湛江人有责任、有义务热爱海洋、保护海洋、关心海洋、关注国家的海洋政治与海洋战略。湛江的学者也应，为海洋“立心”，为国民“请命”，为国家献计献策。他认为，湛江应对市民特别是广大干部和大中小学学生展开海洋国情教育，开展丰富多彩的海洋科普宣传。
最后，巩教授认为，21 世纪第二个十年是中国极为重要的战略机遇期，是中国可以大有作为的重要战略机遇期。从中华民族伟大复兴的历史视野来看，很可能是中国历史进程中的一个重要“拐点”，在新的历史背景下，影响中国战略机遇期的新因素日益增多，中国面临的内外机遇和挑战都在增多，机遇处理不好可能变成挑战，挑战应对得当可能转化成新的机遇。在南海争端中，中国仍然需要从战略高度释放政治善意、作出友好举动、展现和平姿态。笔者以为，我国既不能委曲求全来“软招”，也不能好勇斗狠使“硬招”，而是要审时度势用“和招”。但是，当我国的重要利益受到严重侵害，所有“和招”均失效的情况下，中国该“出手”时就要“出手”，既不忘战，也不好战，更不畏战。当有人非要将战争强加在中国人民身上时，我们只能选择以战止战、以战求和，只有如此，方可化解南海战略局势全面恶化的可能，才能将南海争端的话语权和主动权掌握在自己手中！
