然而，由于地处城中村，河道较长，管理体制等客观原因，治理菉塘河难以彻底，2015年河道再次严重污染。菉塘河中下游段河水黑臭
菉塘河是流经霞山区、开发区内主要河流，长度为6.20公里，它承担了该片区的排涝防潮的基本任务。河涌上游段主要为自然断面，宽度为6-9.2m，沿程排污口有6个，部分河段排污管道直接安置于河道中。
目前，菉塘河截污工程的人民大道二号桥以西段已完成，实现了无明沟排污。但中、下游段河水黑臭情况普遍，出海口段水体恶臭乌黑，已严重影响到霞山观海长廊及周边市民的生活和市容市貌，菉塘河综合整治工程的实施已迫在眉睫。
困局：菉塘河为何“屡治屡污”？
调查发现，菉塘河沿岸均有多个排污口，且排污口排出的污水明显影响到了排污口附近水体的水质。同时流域内只有部分村庄配备了雨污合流的排污管或排污明沟，相当部分村没有任何排污排水设施，甚至有的村民还没有修建化粪池，上游农村生活污水绝大多数未经处理直接排放，导致一些地区的污水横流。
就菉塘河屡屡整治、屡屡受污的问题，记者采访了市河涌整治联席办负责人。他表示，目前来说，菉塘河整治存在以下问题：
菉塘河水系连通性较差、该流域缺乏稳定清水水源。水系不发达，水系自成体系，没有交叉，不利于河道水体交换，也不利于调水补水。洼地等被填埋，河涌堵塞变窄，湿地保护不够等，导致蓄水水体面积减少。没有固定补给，多数以两岸雨水、生活排水补给为主，河流断流和干涸是水生态系统最大的破坏因素。并且地势坡降较大，河道内存水比较困难。
